Portfolio · Ricerca e istituzioni
Stazione Zoologica Anton Dohrn. Il plancton dell'Africa occidentale, in un portale di dati
Per la Stazione Zoologica Anton Dohrn abbiamo progettato e realizzato SZN Marine Observatory: il sito sui dati della Corrente delle Canarie in Guinea e Mauritania e il database delle immagini di plancton su CKAN.
- Ricerca e istituzioni
- Napoli
- 2023
Il cliente
Stazione Zoologica Anton Dohrn
La Stazione Zoologica Anton Dohrn è l’Istituto nazionale di biologia, ecologia e biotecnologie marine, fondato a Napoli nel 1872 da Anton Dohrn.
Il progetto nasce dalle ricerche della Stazione sul plancton del Golfo di Napoli e dell’Africa nord-occidentale, nell’ecosistema della Corrente delle Canarie (CCLME), insieme ai partner DEMERSTEM, Unione Europea, UEMOA e PESCAO.
Le sfide
Da dove partivamo
- Dati satellitari, campioni e immagini al microscopio sparsi tra file e presentazioni
- Due regioni, Guinea e Mauritania, da raccontare a un pubblico scientifico internazionale
- Un archivio di immagini da catalogare e rendere consultabile
Scheda progetto
- Cliente
- Stazione Zoologica Anton Dohrn
- Settore
- Ricerca e istituzioni
- Località
- Napoli
- Anno
- 2023
- Servizi
- Siti web e e-commerce, Software gestionali e web app, Connettori API e integrazioni, Cloud e server, Backup e continuità operativa
- Studio
- Melograno
01 · Progetto e design
Dal wireframe al layout
Con le ricercatrici abbiamo progettato la struttura e i layout di SZN Marine Observatory: una mappa per entrare nella regione, una pagina per l'ecosistema e una per ogni area, con dati e specie.
Perché
Chi fa ricerca deve arrivare ai dati in pochi passaggi.
Si parte dalla mappa
La home è una mappa: l'area del Canary Current è evidenziata e porta alle pagine del progetto.
La mappa della home
L'ecosistema e le sue regioni
La pagina del CCLME spiega la corrente e l'upwelling e apre le due regioni studiate, Guinea e Mauritania.
La pagina del Canary Current
02 · Dati e mappe
I dati del mare, da scaricare
Per Guinea e Mauritania il sito mostra clorofilla, temperatura superficiale del mare e indice di upwelling da dati satellitari, con i file da scaricare in TXT, NetCDF e CSV.
Perché
Le mappe si leggono subito, i file servono a chi vuole rifare le analisi.
Clorofilla, temperatura e upwelling
Tre indicatori per ogni regione, ognuno con la sua mappa e i dati originali da scaricare.
I dati abiotici della Guinea
03 · Schede delle specie
Ogni specie, una scheda
Fitoplancton e zooplancton hanno schede con immagini al microscopio, misure, distribuzione, bibliografia e collegamenti a WoRMS e AlgaeBase. Per i copepodi ci sono le chiavi di identificazione con i caratteri di femmine e maschi.
Il plancton di ogni regione
Le specie trovate nei campioni, ognuna con la sua immagine al microscopio.
Il fitoplancton della Guinea
La scheda
Descrizione, misure e distribuzione accanto alla foto, poi bibliografia e collegamenti ai database internazionali.
La scheda di Planktoniella sol
04 · Database delle immagini
Un portale di dati su CKAN
Per l'archivio delle immagini abbiamo scelto CKAN, la piattaforma open source dei portali di dati pubblici: dataset per regione e per gruppo, ricerca per esemplari e collezioni, a partire dal catalogo delle ricercatrici.
Perché
Uno standard aperto rende i dati riusabili e interrogabili anche via API.
Cercare tra le immagini
Una ricerca unica per specie, stazioni e dataset, con i contatori di fitoplancton e zooplancton.
Anteprima con dati di esempioLa ricerca del portale
I dataset
Guinea, Mauritania, fitoplancton e zooplancton: ogni raccolta ha la sua scheda e i suoi file.
Anteprima con dati di esempioI dataset in evidenza
05 · Cloud e sicurezza
Ospitato e protetto
Abbiamo messo sito e database sulla nostra infrastruttura cloud, con una macchina virtuale dedicata al database, e ci siamo occupati di backup, privacy, cookie e consenso.
Risultati
Cosa è cambiato
Due regioni documentate
Guinea e Mauritania, con dati, mappe e specie.
Dati aperti e scaricabili
Clorofilla, temperatura del mare e upwelling in TXT, NetCDF e CSV.
Schede con le fonti
Ogni specie rimanda a bibliografia, WoRMS e AlgaeBase.
Fonte: SZN Marine Observatory, 2023.
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